Блог

Apr 26, 2024

Обнаружение респираторного вируса в верхних дыхательных путях у бессимптомных, внебольничных

BMC Инфекционные заболевания, том 22, Номер статьи: 411 (2022) Цитировать эту статью 1572 Доступов 3 Цитирования 46 Подробности об альтернативных показателях Распространенность положительного результата на вирус в верхних дыхательных путях

BMC Инфекционные болезни, том 22, Номер статьи: 411 (2022 г.) Цитировать эту статью

1572 Доступа

3 цитаты

46 Альтметрика

Подробности о метриках

Распространенность положительного результата вируса в верхних дыхательных путях у бессимптомных пожилых людей, проживающих в сообществе, остается неясной. Нашей целью было изучить распространенность положительного результата ПЦР на респираторный вирус у бессимптомных пожилых людей, проживающих в сообществе, с использованием образцов слюны, а также мазков из носоглотки и ротоглотки.

Мы проанализировали 504 взрослых в возрасте ≥ 65 лет, проживающих в сообществе, которые находились на амбулаторном лечении и были включены в перекрестное исследование, проведенное с февраля по декабрь 2018 года в городе Нагасаки, Япония. Четырнадцать респираторных вирусов были идентифицированы в образцах слюны, носоглотки и ротоглотки с помощью мультиплексной ПЦР-анализа.

Распространенность положительного результата ПЦР на риновирус, грипп А, энтеровирус и любой респираторный вирус составила 12,9% (95% ДИ: 10,1–16,1%), 7,1% (95% ДИ: 5,1–9,8%), 6,9% (95% ДИ: 4,9–9,5%) и 25,2% (95% ДИ: 21,5–29,2%) соответственно. Риновирус был обнаружен у 21,5% испытуемых, грипп А - у 38,9% испытуемых, энтеровирус - у 51,4% испытуемых и любой вирус - у 32,3% испытуемых при использовании только проб слюны.

Распространенность нескольких респираторных вирусов была выше, чем ранее сообщалось в образцах из глотки молодых людей. Отбор проб слюны является потенциально полезным методом выявления респираторных вирусов в бессимптомных группах населения.

Отчеты экспертной оценки

Внедрение полимеразной цепной реакции (ПЦР) в более широких клинических условиях способствует быстрому и точному обнаружению респираторных вирусов, выявляя респираторные вирусы как распространенные возбудители внебольничной пневмонии [1,2,3]. В нескольких исследованиях сообщалось о распространенности положительного результата на вирус в верхних дыхательных путях у бессимптомных субъектов [4,5,6]; однако распространенность среди пожилых людей, проживающих в сообществе, восприимчивых к тяжелым заболеваниям в случае заражения, еще не изучена.

Выявление респираторных вирусов в носоглотке с помощью молекулярно-биологических методов является стандартным методом выявления респираторных вирусных инфекций [7]. Однако образцы слюны являются потенциальными альтернативными образцами; Взятие слюны менее инвазивно и связано с меньшим риском передачи, чем взятие мазка из носоглотки (НП). Сообщалось о пользе отбора проб слюны для обнаружения вируса с помощью ПЦР у пациентов, инфицированных обычными респираторными вирусами и коронавирусом тяжелого острого респираторного синдрома 2 (SARS-CoV-2) [8,9,10,11,12].

Основная цель этого исследования состояла в том, чтобы изучить распространенность выявления респираторных вирусов с помощью ПЦР у бессимптомных пожилых людей, проживающих в местных сообществах в Японии. Вторичная цель заключалась в изучении возможности использования слюны в дополнение к забору проб из глотки для наблюдения за распространенностью в бессимптомных популяциях.

Этот анализ был реализован в рамках следующего существующего исследования: «Низкая распространенность носительства пневмококка среди пожилых людей, проживающих в сообществе: поперечное исследование в Японии» [13]. Все методы проводились в соответствии с Хельсинкской декларацией, и исследование было одобрено Советом по этической экспертизе Института тропической медицины Университета Нагасаки, Нагасаки, Япония, а также институциональными наблюдательными советами каждого исследовательского учреждения. Письменное информированное согласие было получено от всех участников или их семей. Исследование проводилось с февраля 2018 года по декабрь 2018 года в городе Нагасаки, Япония. Мы включили проживающих в сообществе пожилых людей в возрасте ≥ 65 лет, которые были амбулаторными и регулярно посещали клиники или амбулаторные реабилитационные визиты в 4 больницах города Нагасаки, Япония. Мы исключили людей с лихорадкой или какими-либо симптомами инфекции верхних дыхательных путей, людей, получавших лечение антибиотиками в течение предыдущих 30 дней, а также людей, которые были госпитализированы в больницу или учреждение длительного ухода на ≥ 7 дней в течение предыдущих 30 дней. Подробная демографическая и клиническая информация о 504 участниках была описана ранее [13]. Образцы NP и ротоглотки (OP) получали с использованием двух тампонов: один образец из носоглотки с использованием стерилизованного тампона с алюминиевым стержнем (TE2201) (Eiken Chemical Co., Токио, Япония) и другой образец из ротоглотки с использованием стерилизованного тампона с деревянный вал (TE8201) (Eiken Chemical Co., Токио, Япония). Эти тампоны немедленно индивидуально помещали в 1 мл среды обезжиренного молока, триптона, глюкозы и глицерина (СТГГ) [14]. Участников попросили сплюнуть внутрь стерилизованного контейнера для мокроты (DE2000) (Eiken Chemical Co., Токио, Япония), чтобы собрать чистую слюну без мокроты. Подробную информацию об использовании этих стерилизованных тампонов и контейнеров для мокроты можно получить в Интернете у производителя [15]. Образцы собирали исследователи или обученные медсестры-исследователи. Вирусные нуклеиновые кислоты экстрагировали с использованием мини-набора вирусной РНК QIAamp (QIAGEN Inc., Валенсия, Калифорния, США) и мини-набора QIAamp DNA (QIAGEN Inc., Валенсия, Калифорния, США), а следующие четырнадцать респираторных вирусов подвергали мультиплексному скринингу. ПЦР-анализ с использованием набора One Step RT-PCR Kit (QIAGEN Inc., Валенсия, Калифорния, США) для РНК-вирусов и ДНК-полимеразы GoTaq Flexi (Promega, Сан-Луис-Обиспо, Калифорния, США) и смеси нуклеотидов для ПЦР (Promega, Сан-Луис-Обиспо) , Калифорния, США) для ДНК-вирусов, как описано ранее [16]: гриппа А, гриппа В, респираторно-синцитиального вируса (РСВ), метапневмовируса человека (hMPV), вируса парагриппа типов 1–4 (PIV-1, PIV-2, PIV-3 и PIV-4), риновирус, коронавирус 229E, OC43 (общий человеческий коронавирус [HCoV]), аденовирус, бокавирус и энтеровирус. Дополнительный файл 1 показывает чувствительность (предел обнаружения) мультиплексной ПЦР [см. Дополнительный файл 1]. Распространенность положительного результата ПЦР для респираторных вирусов определялась как общая распространенность, обнаруженная по крайней мере в одном образце NP, OP и/или слюны. Расчет распространенности положительного результата ПЦР показан в Дополнительном файле 2: Рис. S1. Коэффициент каппа Коэна (κ) рассчитывался для измерения согласия между каждой парой мест отбора проб.